Depuis le 1er septembre 2026, on parle beaucoup de facturation électronique, mais la plupart de vos fournisseurs continuent de vous envoyer leurs factures par email, en PDF ou sur papier ? Vous vous demandez si vous pouvez toujours les payer, les comptabiliser et déduire la TVA ? Voici la réponse.
Oui, vous pouvez les traiter, les payer et les comptabiliser
Une facture reçue par mail, PDF ou papier ne doit pas être écartée au seul motif qu'elle n'est pas passée par le circuit de la facturation électronique, dès lors qu'elle correspond à une opération réelle et qu'elle comporte les informations nécessaires à son traitement.
La réforme change la manière dont les factures circulent entre entreprises. Elle ne change pas les règles de fond : existence de l'opération, dette envers le fournisseur, paiement, comptabilisation et droit à déduction de la TVA.
Et pour la déduction de la TVA ?
Le seul fait qu'une facture ne vous soit pas parvenue par le circuit électronique ne vous prive pas automatiquement de votre droit à déduire la TVA. Ce droit continue d'être apprécié selon les conditions habituelles. Comme avant la réforme, vérifiez que la facture mentionne bien :
La réalité de l'opération,
L'identification de votre fournisseur et de votre entreprise,
Les mentions obligatoires,
Le montant et la TVA, le cas échéant.
Votre fournisseur de matériel, une TPE, vous envoie sa facture en PDF par email en octobre 2026 ? Vous pouvez la payer, l'enregistrer dans votre comptabilité et déduire la TVA comme vous le faisiez avant.
Pourquoi vos fournisseurs vous envoient encore des PDF
Pour le moment, seules les grandes entreprises et les ETI ont l'obligation d'émettre leurs factures au format électronique. Les PME, TPE et indépendants n'y seront tenus qu'à partir du 1ᵉʳ septembre 2027, et les fournisseurs établis à l'étranger ne sont pas concernés par la réforme française.
Tant que votre fournisseur n'a pas l'obligation d'émettre en électronique, il est donc tout à fait normal que vous ne receviez pas de facture électronique de sa part. Si vous voulez comprendre pourquoi une facture attendue n'arrive pas, consultez notre article sur les factures qui ne vous parviennent pas en électronique.
Ce qui change quand même sur Indy
Même si votre droit à déduire reste identique, deux différences existent pour ces factures :
Elles n'apparaissent pas dans Documents > Factures reçues, cet espace étant réservé aux factures qui transitent par le circuit électronique,
La TVA déductible n'est pas préremplie automatiquement : si vous déclarez votre TVA en dehors d'Indy, pensez à la reporter manuellement.
Et si mon fournisseur devait m'envoyer cette facture en électronique ?
Si votre fournisseur est une grande entreprise ou une ETI, il est soumis à l'obligation d'émission électronique. Vous pouvez alors lui demander de transmettre la même facture par le circuit prévu, mais ce n'est pas obligatoire, et ce n'est jamais une condition pour pouvoir la payer ou déduire la TVA.
⛔ Si vous recevez finalement la même facture par plusieurs canaux (par exemple en PDF, puis en électronique), ne la traitez qu'une seule fois : retenez une facture de référence, et considérez l'autre comme une copie pour éviter un double paiement, une double comptabilisation ou une double déduction de TVA.
💡 Cette position est celle de l'administration fiscale, vous la retrouverez dans le guide pratique de démarrage de la facturation électronique publié par la DGFiP.
Pour toutes questions supplémentaires, n'hésitez pas à revenir vers nous via le live-chat en bas à droite 😉
À très vite !